En 1960, le Département de sociologie crée un baccalauréat en anthropologie. Suite à une recommandation du Conseil de la Faculté des sciences sociales, économiques et politiques, le département d'anthropologie est fondé le 1er juin 1961 et Guy Dubreuil est nommé directeur. En 1962, une trentaine d'étudiants sont inscrits en maîtrise et 7 professeurs donnent l'enseignement. La recherche constitue le principal objectif du département d'anthropologie et le financement provient de l'Université, mais surtout de subventions d'état et de fondations privées. Deux organismes sont créés : La Société d'anthropologie de Montréal qui a pour rôle de transmettre des connaissances en anthropologie auprès du public et le GASPEC (Groupe anthropologique et sociologique pour l'étude des communautés) qui rassemble des professeurs et des étudiants pour des travaux de stages ou de recherches. En avril 1963, le Dr Jean Benoist remplace Guy Dubreuil pendant son absence, mais il démissionnera en 1964. Lionel Vallée lui succédera de 1965 à 1968, puis ce sera Guy Dubreuil qui reprendra la direction du département de juin 1968 à juin 1972. En 1971, les programmes du certificat sont modifiés. De nouveaux certificats sont créés et modifiés en études africaines. De 1972 à 1976 Franklin Auger prend la tête du département, puis, en 1977, Jacques Gomila et enfin Paul Tolstoy, de juin 1977 à mai 1981. En 1980, les programmes du 1er cycle sont modifiés. Ceux du 2e cycle le seront en 1982. Normand Clermont est nommé directeur intérim pour la période de juin 1981 à août 1982, puis Gilles Bibeau de juin 1982 à mai 1986. Un projet de formation en muséologie est à l'étude en novembre 1982. En 1986, Norman Clermont reprend l'intérim jusqu'en 1987. Gilles Bibeau le remplace de 1987 à 1991. Dès 1991, Louise Paradis est la directrice du département d'anthropologie.